Eternal Darkeness é conduzido a partir de uma perspectiva em terceira pessoa, focando-se no modo Survival Horror, estilo Resident Evil. Também possui vários Puzzles para serem resolvidos ao longo da jogatina. A trama gira em torno de muitas histórias, que são divididas em quatro partes, a primeira conta a história de Alexandra Roivas, uma jovem estudante vinda de Washington que volta a uma enorme mansão cujo seu avô morava, infelizmente após o seu retorno o encontra brutalmente assassinado.
Apesar de não se focar em apenas uma história, o jogo te leva até anos A.C e D.C, contendo muitas histórias separadas e muitos personagens envolventes. Ao todo são quatro histórias que se dividem dando pontas umas as outras. Há também certos locais como por exemplo: A Cidade Proibida, na Pérsia, um templo Khmer em Angkor Thom, Catedral de Oublíe em Amiens e a propriedade da família Roivas Em Rhode Island.
