Tom Clancy's EndWar é um jogo de estratégia baseado em turnos do gênero Advanced Wars. O cenário de guerra, inspirado em Tom Clancy, é o de uma hipotética terceira guerra mundial em meados do século 21 envolvendo os Estados Unidos da América, o novo Federação e Rússia em três áreas diferentes do mundo (Europa, Estreito de Bering e região do Mar Negro).
Os jogadores podem escolher entre os modos campanha e batalha, sendo que este último pode desafiar a IA ou outro jogador. Além disso, o título permite aos jogadores criar até 32 mapas pessoais e compartilhá-los com outros usuários.
Os eventos começam após uma grande crise global do petróleo. A procura de petróleo aumenta de tal forma que o conflito é agora inevitável. A Rússia inicia as hostilidades tentando invadir o Alasca, à medida que a rivalidade entre a Europa e os Estados Unidos se transforma num conflito armado. A campanha começa no continente europeu e em particular na metrópole de Londres.
Assim que o jogador demonstrar que é capaz de liderar os diversos tipos de tropas, a história continua no Estreito de Bering entre o Alasca e a Sibéria e, finalmente, o jogador poderá enfrentar as últimas doze missões definidas na região do Mar Negro.
